10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3490 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3490  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2025  hypothetical protein  36.59 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349188  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0044  hypothetical protein  30.59 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3138  hypothetical protein  37.84 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2129  hypothetical protein  29.27 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4385  hypothetical protein  36.67 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0287818  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0533  hypothetical protein  26.74 
 
 
113 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4478  hypothetical protein  32.35 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.370909  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4073  hypothetical protein  40.62 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0983  hypothetical protein  31.88 
 
 
100 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>