12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2881 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2881  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3260  hypothetical protein  37.43 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3685  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0865  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 205 aa  100  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1138  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331143  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2884  hypothetical protein  31.67 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3918  hypothetical protein  31.25 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.825288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1482  hypothetical protein  27.05 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4597  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.794449  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0124  hypothetical protein  23.74 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0115344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  43.18 
 
 		 254 aa  44.7  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2763  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>