58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2144 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  100 
 
 		 173 aa  337  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  37.25 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  31.1 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  31.68 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  31.37 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  30.43 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  30.43 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  32.89 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  28.87 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  30.92 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  30.92 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  27.85 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  30.46 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  25.45 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  30.46 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.06 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  30.25 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  28.86 
 
 		 175 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  31.9 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  27.22 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  30.52 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  24.85 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  27.39 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  27.39 
 
 		 201 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  27.46 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  26.32 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  25 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  26.71 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  23.13 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  25.66 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.92 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  30.71 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  26.49 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  23.6 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  23.6 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.52 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  27.88 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  26.75 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  25.44 
 
 		 175 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  24.49 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  25.15 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  28.12 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  29.22 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  30.23 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  30.23 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  30.23 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  23.13 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  29.13 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  29.13 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  29.13 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>