12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1375 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1375  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0053  tRNA-Glu  94.52 
 
 		 75 bp  113  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0197989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0023  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0025  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0023  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0025  tRNA-Glu  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328382 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0015  tRNA-Glu  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1585  tRNA-Glu  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0040  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6497  hitchhiker  0.000739711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0049  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0050  tRNA-Glu  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>