253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1110 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1110  protein MraZ  100 
 
 
270 aa  551  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.701807 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0172  hypothetical protein  76.22 
 
 
173 aa  244  9.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.438728  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1587  MraZ protein  63.31 
 
 
157 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22890  mraZ protein  59.86 
 
 
154 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544234  normal  0.034348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1275  MraZ protein  53.69 
 
 
155 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16650  mraZ protein  54.55 
 
 
143 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.103702  normal  0.0109751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1065  MraZ protein  52.82 
 
 
150 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208213  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1562  cell division protein MraZ  53.15 
 
 
142 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1561  cell division protein MraZ  52.45 
 
 
142 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3208  cell division protein MraZ  54.55 
 
 
143 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000170601  normal  0.0171903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2662  MraZ protein  53.9 
 
 
143 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.725821  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3447  cell division protein MraZ  54.93 
 
 
142 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0414868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13690  cell division protein MraZ  52.45 
 
 
143 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3221  cell division protein MraZ  53.52 
 
 
142 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0311021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1398  MraZ protein  48.95 
 
 
143 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816682  normal  0.0107217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2861  cell division protein MraZ  48.95 
 
 
143 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2935  MraZ protein  48.25 
 
 
143 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000665289  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5107  cell division protein MraZ  48.95 
 
 
143 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373154  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10720  mraZ protein  49.65 
 
 
143 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1406  cell division protein MraZ  47.55 
 
 
143 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00827129  hitchhiker  0.00155584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0887  MraZ protein  47.55 
 
 
143 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1101  cell division protein MraZ  46.15 
 
 
143 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1001  cell division protein MraZ  46.81 
 
 
144 aa  155  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0954515  normal  0.226579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24980  mraZ protein  45.45 
 
 
143 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2419  MraZ protein  49.59 
 
 
143 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.698381  normal  0.0439129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5775  MraZ protein  44.06 
 
 
143 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1268  MraZ protein  41.73 
 
 
143 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1652  MraZ protein  46.76 
 
 
148 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09000  MraZ protein  42.96 
 
 
143 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2018  cell division protein MraZ  41.3 
 
 
143 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0743  cell division protein MraZ  38.85 
 
 
143 aa  131  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.153316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1295  MraZ protein  41.73 
 
 
143 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1617  MraZ protein  45.19 
 
 
144 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3072  MraZ protein  48.12 
 
 
144 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0171483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3265  cell division protein MraZ  40.56 
 
 
143 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3327  cell division protein MraZ  40.56 
 
 
143 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3276  cell division protein MraZ  40.56 
 
 
143 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0666  cell division protein MraZ  38.13 
 
 
142 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1152  cell division protein MraZ  37.68 
 
 
143 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1237  cell division protein MraZ  39.57 
 
 
143 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1262  cell division protein MraZ  39.57 
 
 
143 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0817  hypothetical protein  35.97 
 
 
143 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0982  cell division protein MraZ  37.5 
 
 
143 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.504694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1210  cell division protein MraZ  36.23 
 
 
143 aa  122  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.192448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4072  cell division protein MraZ  38.13 
 
 
143 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0834  cell division protein MraZ  41.01 
 
 
143 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.54539 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1573  MraZ protein  34.29 
 
 
149 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12196  cell division protein MraZ  39.16 
 
 
143 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.435477  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1445  MraZ protein  34.72 
 
 
174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0153914  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0584  cell division protein MraZ  36.96 
 
 
142 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0769  cell division protein MraZ  38.33 
 
 
143 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0735205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2979  cell division protein MraZ  40.28 
 
 
144 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182358  normal  0.359806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2655  MraZ protein  38.46 
 
 
143 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.895662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3934  MraZ protein  41.18 
 
 
144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0143451  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1045  MraZ protein  38.85 
 
 
145 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0475  cell division protein MraZ  39.68 
 
 
143 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000349063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3532  cell division protein MraZ  38.89 
 
 
144 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0208024  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1501  cell division protein MraZ  37.41 
 
 
143 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2480  MraZ protein  43.8 
 
 
141 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3026  MraZ protein  39.23 
 
 
146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.20935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3271  MraZ protein  39.86 
 
 
144 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.000275591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1104  MraZ protein  39.2 
 
 
143 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000730324  normal  0.996459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3520  MraZ protein  41.13 
 
 
143 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3777  MraZ protein  38.4 
 
 
143 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  unclonable  0.00000602512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1208  MraZ protein  31.39 
 
 
137 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2843  MraZ protein  34.43 
 
 
143 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0765  cell division protein MraZ  37.29 
 
 
142 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1984  MraZ protein  33.81 
 
 
143 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1256  MraZ protein  36.59 
 
 
146 aa  99  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00006423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6970  MraZ protein  36.36 
 
 
155 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1681  MraZ protein  34.43 
 
 
144 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1996  MraZ protein  36.67 
 
 
144 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.359835  normal  0.384636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0839  cell division protein MraZ  34.85 
 
 
147 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1501  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00904866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_281  MraZ protein  33.83 
 
 
142 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000252688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0319  MraZ protein  33.83 
 
 
142 aa  93.2  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3462  MraZ protein  33.57 
 
 
150 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_002936  DET0340  MraZ  32.35 
 
 
142 aa  90.5  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000320074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0974  cell division protein MraZ  35.37 
 
 
152 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0944  cell division protein MraZ  35.37 
 
 
152 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2709  MraZ protein  32.12 
 
 
147 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0155506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2615  MraZ protein  37.39 
 
 
151 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0863  MraZ protein  35.54 
 
 
141 aa  89.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2749  mraZ-like  30.71 
 
 
151 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2461  cell division protein MraZ  33.59 
 
 
150 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2437  cell division protein MraZ  32.79 
 
 
152 aa  86.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0346  cell division protein MraZ  32.03 
 
 
152 aa  85.5  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0737  MraZ protein  33.83 
 
 
151 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0135591  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3813  cell division protein MraZ  31.25 
 
 
152 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1197  cell division protein MraZ  29.63 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000030245  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0204  cell division protein MraZ  30.77 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl395  cell division protein MraZ  30.22 
 
 
151 aa  82  0.000000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000155382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1992  cell division protein MraZ  30.77 
 
 
160 aa  82  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.085439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4228  cell division protein MraZ  32.79 
 
 
152 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0478  cell division protein MraZ  31.97 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.510022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0377  cell division protein MraZ  31.97 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.785463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3579  cell division protein MraZ  31.97 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.432184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3752  cell division protein MraZ  31.97 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0760  cell division protein MraZ  31.4 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0392  cell division protein MraZ  31.15 
 
 
152 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>