45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4096 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  58 
 
 
159 aa  197  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  54.79 
 
 
153 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  40.4 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  39.73 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  36.77 
 
 
159 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  31.29 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  37.41 
 
 
152 aa  97.1  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  30.2 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  33.11 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  29.71 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  28.3 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  33.57 
 
 
144 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  29.71 
 
 
152 aa  84  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  35.04 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  31.88 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  31.82 
 
 
142 aa  82  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  31.91 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  34.42 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  29.41 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  28.77 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  31.88 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  29.63 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  28.77 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  32.65 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  30.37 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  28.33 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  27.97 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  25.97 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  37.04 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  32 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  28.46 
 
 
154 aa  61.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  31.97 
 
 
134 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  25.76 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  30.83 
 
 
145 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  29.75 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  33.04 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  27.19 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  29.51 
 
 
145 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  28.69 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  24.3 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  35.87 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>