19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3638 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3638  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0190934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0725  hypothetical protein  36.59 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.966908  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0139  hypothetical protein  43.51 
 
 
204 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1497  hypothetical protein  38.56 
 
 
169 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1517  hypothetical protein  32.45 
 
 
167 aa  96.7  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000419418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1707  hypothetical protein  29.75 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0061  hypothetical protein  30.72 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1183  hypothetical protein  29.49 
 
 
166 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3816  hypothetical protein  35.62 
 
 
170 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3866  hypothetical protein  35.62 
 
 
170 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1483  hypothetical protein  28.02 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000670899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2957  hypothetical protein  30.92 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000744507  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0989  hypothetical protein  28 
 
 
165 aa  82  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0192  hypothetical protein  27.59 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657817  normal  0.649319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0159  hypothetical protein  30.92 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0288442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0098  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00649909  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1053  hypothetical protein  22.58 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4496  hypothetical protein  26.11 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369781  normal  0.0155475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1245  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.168393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>