18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3519 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3519  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  295  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0062  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.760214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0305  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1105  phage protein  27.82 
 
 
131 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000280512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2955  hypothetical protein  35.97 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0806  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2880  hypothetical protein  33.07 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0885  putative prophage Lp2 protein 26  44.05 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0339  hypothetical protein  31.09 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.729949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0330  hypothetical protein  31.09 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.614067  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1045  hypothetical protein  31.09 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1064  hypothetical protein  31.09 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0645  YopX protein  29.77 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2223  YopX protein  29.77 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0297  prophage Lp1 protein 30  33.71 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0749402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3842  hypothetical protein  38.37 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.262534 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0572  hypothetical protein  32.61 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4017  hypothetical protein  30.71 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>