15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2518 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  233  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.05 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2851  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.6 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.48842e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2047  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.79 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.27 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  31.52 
 
 		 119 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  26.37 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2324  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2557  hypothetical protein  27.96 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.059433  normal  0.792105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  30.93 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  28.41 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  31.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  29.7 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.22 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.739579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>