14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2020 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  49.48 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  49.3 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  42.75 
 
 		 285 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  41.92 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  31.3 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  25.83 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  23.84 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  22.1 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  24.8 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  20.65 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  29.7 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  29.7 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  20.65 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>