43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0991 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  41.94 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  35.77 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  41.54 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  28.91 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  31.78 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  28.46 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  38.69 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  30.33 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31350  hypothetical protein  38.52 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0333034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  28.03 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  31.97 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  30.65 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  31.15 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  27.64 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  27.59 
 
 
159 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  26.02 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  25.41 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  31.97 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  25.41 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  31.93 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  29.51 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  28.24 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  24.59 
 
 
149 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  29.69 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  29.91 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  24.41 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  27.56 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  27.12 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  28.12 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  29.77 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  34.29 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  28.41 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  28.81 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2043  protein of unknown function DUF180  32.23 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.937686 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  17.65 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  24.41 
 
 
156 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  27.83 
 
 
159 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  29.51 
 
 
154 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  28.69 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  25.98 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  25 
 
 
168 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>