31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0809 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  52.46 
 
 
231 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  50 
 
 
366 aa  174  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  44.07 
 
 
194 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  48.9 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  47.73 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  48.6 
 
 
183 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  48.6 
 
 
183 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  47.8 
 
 
272 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  48.04 
 
 
183 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  46.63 
 
 
198 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  47.06 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  44.71 
 
 
194 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  45.61 
 
 
191 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  42.37 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  25.83 
 
 
278 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  24.54 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  23.78 
 
 
267 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  24.55 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  28.77 
 
 
311 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  29.29 
 
 
304 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0491  hypothetical protein  23.39 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.754962  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  26.43 
 
 
286 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  23.97 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  27.54 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  24 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  23.33 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  30 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  23.91 
 
 
272 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  23.78 
 
 
270 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>