17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0571 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0571  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  327  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4404  hypothetical protein  48.47 
 
 
164 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1143  hypothetical protein  45.12 
 
 
166 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3736  hypothetical protein  43.48 
 
 
164 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3938  hypothetical protein  41.61 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.93013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9030  hypothetical protein  45.89 
 
 
165 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779481  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2814  hypothetical protein  42.59 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384746  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6190  hypothetical protein  40.24 
 
 
166 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4232  hypothetical protein  48.03 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3308  hypothetical protein  44.38 
 
 
166 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4259  hypothetical protein  42.5 
 
 
163 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4504  hypothetical protein  39.51 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4464  hypothetical protein  46.72 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05960  hypothetical protein  39.39 
 
 
165 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.534125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0469  hypothetical protein  35.19 
 
 
164 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0201  hypothetical protein  35.67 
 
 
161 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3729  hypothetical protein  40.12 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0248179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>