14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2429 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2429  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 120 aa  240  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2995  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.28 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2621  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  49 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  47.87 
 
 		 116 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  44.64 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1592  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  48 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2712  hypothetical protein  33.01 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1740  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.66 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000969035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1605  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.71 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0237  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 669 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0874018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2529  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.51 
 
 		 731 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  36.11 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>