49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0441 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0441  flagellar assembly protein FliW  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4096  flagellar assembly protein FliW  54.79 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3040  flagellar assembly protein FliW  57.97 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2233  flagellar assembly protein FliW  41.43 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000631817 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4192  protein of unknown function DUF180  37.58 
 
 		 152 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3027  flagellar assembly protein FliW  34.06 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0749  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.746617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0020  protein of unknown function DUF180  34.53 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3225  flagellar assembly protein FliW  33.81 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2240  flagellar assembly protein FliW  32.12 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0454  flagellar assembly protein FliW  27.86 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0247  flagellar assembly protein FliW  32.37 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1670  flagellar assembly protein FliW  30.15 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0670  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0326033 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17100  hypothetical protein  34.29 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2354  flagellar assembly protein FliW  34.56 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1512  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 		 146 aa  84.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0098  flagellar assembly protein FliW  30.87 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1146  flagellar assembly protein FliW  34.59 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0667  protein of unknown function DUF180  27.94 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0605  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0081  hypothetical protein  30.94 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0195  hypothetical protein  28.1 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0843  flagellar assembly protein FliW  29.85 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0866  flagellar assembly protein FliW  29.55 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0391  hypothetical protein  27.7 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0308  hypothetical protein  28.29 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2527  flagellar assembly protein FliW  30.07 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2419  flagellar assembly protein FliW  34.71 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.423984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0389  hypothetical protein  32.12 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166292  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0771  hypothetical protein  32.28 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0991  protein of unknown function DUF180  31.97 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.277232  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0183  flagellar assembly protein FliW  23.53 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2743  flagellar assembly protein FliW  34.07 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2400  flagellar assembly protein FliW  32.23 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1998  flagellar assembly protein FliW  30.08 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3149  flagellar assembly protein FliW  30.88 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212103  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0613  protein of unknown function DUF180  23.74 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0820  flagellar assembly protein FliW  32.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.900553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1620  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0959  flagellar assembly protein FliW  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2359  protein of unknown function DUF180  33.33 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0830  hypothetical protein  31.2 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.258231  normal  0.70699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1619  protein of unknown function DUF180  30.85 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0648  flagellar assembly protein FliW  30.28 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486344  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1093  flagellar assembly protein FliW  30.28 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1218  flagellar assembly protein FliW  30.28 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.462259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2416  hypothetical protein  24.6 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3002  protein of unknown function DUF180  29.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000374765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>