15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1187 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  654    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  30.03 
 
 
278 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  30.52 
 
 
280 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  29.87 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  26.3 
 
 
277 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  33.67 
 
 
221 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  28.76 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  33.5 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  25.54 
 
 
280 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  37.3 
 
 
212 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  29.53 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  29.82 
 
 
177 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2295  hypothetical protein  36.49 
 
 
164 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>