9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4713 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4713  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  749    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4297  integrase family protein  29.91 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3724  hypothetical protein  27.47 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2535  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3181  phage integrase family site specific recombinase  28.51 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2382  integrase family protein  23.04 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0941885  normal  0.501513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2669  integrase family protein  28.51 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2752  integrase domain protein SAM domain protein  27.63 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00014768  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2680  integrase family protein  28.51 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>