65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4300 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4300  cutinase  100 
 
 
244 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4311  Cutinase  63.56 
 
 
239 aa  304  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.108303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5793  cutinase  48.44 
 
 
233 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1037  cutinase  47.87 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5361  cutinase  47.22 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5068  cutinase  47.22 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4980  cutinase  47.22 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.354766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4439  cutinase  44.17 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1893  cutinase  43.84 
 
 
241 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1939  cutinase  43.84 
 
 
241 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3177  cutinase  41.98 
 
 
243 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.737474  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1873  cutinase  43.38 
 
 
241 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0829992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5804  cutinase  45.37 
 
 
242 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.748462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5603  cutinase  40.83 
 
 
236 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00618421  normal  0.511306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5223  cutinase  42.66 
 
 
236 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5311  cutinase  42.66 
 
 
236 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13756  cutinase cut5  41.48 
 
 
207 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.166637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3552  cutinase  37.56 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1440  cutinase  43.58 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171019  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3344  cutinase  34.06 
 
 
225 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382665  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12015  cutinase precursor cfp21  37.61 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5679  cutinase  38.54 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4966  cutinase  38.39 
 
 
205 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0417178  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5389  cutinase  38.05 
 
 
231 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5300  cutinase  38.05 
 
 
231 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0499179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13488  cutinase precursor cut3  35.22 
 
 
262 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.957767  normal  0.0619563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4965  cutinase  36.71 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0427886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3373  cutinase  36.13 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201335  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1134  cutinase  37.89 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1146  cutinase  37.89 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238601  normal  0.542823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1117  cutinase  37.89 
 
 
224 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1924  cutinase  35.07 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1441  cutinase  36.32 
 
 
221 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0371  cutinase  37.38 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.656734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4432  cutinase  33.62 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3105  cutinase  35.86 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220847  normal  0.393966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4967  cutinase  36.53 
 
 
220 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0510354  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12324  cutinase cut2  33.49 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4111  cutinase  35.41 
 
 
294 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3117  cutinase  35.55 
 
 
303 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13489  cutinase precursor cut4  37.38 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0687633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1439  cutinase  34.4 
 
 
220 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.91831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1145  cutinase  30.43 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.713358  normal  0.552201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1133  cutinase  30.43 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1116  cutinase  30.43 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.782671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1519  cutinase  32.97 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00723296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1515  cutinase  32.09 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0782878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1514  cutinase  32.91 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0692058  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10346  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14420)  39.81 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.886788  normal  0.0228214 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07180  CutinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AX00]  29.5 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.351006 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05309  cutinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09380)  31.4 
 
 
213 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07541  Cutinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR3]  28.77 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0123002  normal  0.255314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  30.25 
 
 
336 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1283  cutinase  33.33 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00904546  normal  0.674809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1515  cutinase  37.41 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0339808  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  27.62 
 
 
335 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  27.62 
 
 
335 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  27.62 
 
 
335 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0988  cutinase  31.36 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1006  cutinase  31.36 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1016  cutinase  31.36 
 
 
292 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  34.51 
 
 
338 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  26.98 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  33.63 
 
 
335 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  26.41 
 
 
337 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>