22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2832 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2832  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.125265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3299  hypothetical protein  61.9 
 
 
71 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448781  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2960  hypothetical protein  67.74 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3004  hypothetical protein  67.74 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2975  hypothetical protein  67.74 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331956  normal  0.0195637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3515  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2390  protein of unknown function DUF343  60 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0302108  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1767  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  47.37 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  48.33 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  45.16 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.26 
 
 
430 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  39.68 
 
 
62 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  44.26 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  44.26 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  44.64 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  41.94 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>