37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1222 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  100 
 
 
777 aa  1509    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  41.7 
 
 
764 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  42.17 
 
 
751 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  41.7 
 
 
764 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  41.66 
 
 
739 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  42.09 
 
 
756 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  41.53 
 
 
748 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  41.17 
 
 
751 aa  445  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  41.85 
 
 
726 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  39.77 
 
 
747 aa  376  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  35.89 
 
 
758 aa  346  7e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  36.65 
 
 
820 aa  339  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  36.47 
 
 
820 aa  327  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  36.03 
 
 
752 aa  325  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  33.49 
 
 
837 aa  320  6e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  38.52 
 
 
876 aa  307  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  37.67 
 
 
857 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  35.3 
 
 
790 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  34.07 
 
 
789 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  35.07 
 
 
761 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  35.28 
 
 
834 aa  260  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  34.98 
 
 
826 aa  253  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  34.16 
 
 
758 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  33.42 
 
 
789 aa  250  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  32.07 
 
 
759 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  37.38 
 
 
953 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  36.78 
 
 
762 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  29.78 
 
 
822 aa  204  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  36.28 
 
 
817 aa  203  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  35.56 
 
 
745 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  32.46 
 
 
779 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  29.91 
 
 
719 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.33 
 
 
798 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  26.25 
 
 
840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  27.47 
 
 
856 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  21.47 
 
 
557 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 
551 aa  44.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.553593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>