18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1053 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1053  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  248  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0705  hypothetical protein  55 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0190  hypothetical protein  44.33 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055582  normal  0.0653987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10554  hypothetical protein  46.32 
 
 
100 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122166  normal  0.19156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0938  hypothetical protein  50.51 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224055  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0032  hypothetical protein  51.04 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346325  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0706  hypothetical protein  40.66 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0721  hypothetical protein  44.79 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99506  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0741  hypothetical protein  44.79 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.986315  normal  0.0900571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1054  hypothetical protein  37.14 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0724  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.204776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0029  hypothetical protein  32.63 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.405362 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0730  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.548837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0744  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894125  normal  0.0470253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2079  hypothetical protein  34.74 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.241558  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13062  hypothetical protein  34 
 
 
124 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.14878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0941  hypothetical protein  32.97 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0933351  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4280  hypothetical protein  58.06 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393195  normal  0.617607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>