19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0702 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  100 
 
 		 143 aa  275  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  50.39 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  46.34 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  50.89 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  53.15 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  36.11 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  41.13 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  36.36 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  40.91 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  39.62 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  37.5 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  36.59 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  34.38 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  32.85 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  32.56 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  31.97 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  28.69 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>