83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3780 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  93.75 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  70 
 
 		 160 aa  243  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  64.78 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  67.11 
 
 		 160 aa  214  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  65.33 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  58.71 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  33.61 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  28.78 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  31.3 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  31.37 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  33.11 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  33.11 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  26.35 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  29.1 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  27.46 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  30.34 
 
 		 200 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  32.62 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  29.71 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  29.61 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  28.26 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  23.78 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  27.16 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  31.78 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  35 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  36.25 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  32.84 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  27.78 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  30.7 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  41.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 395 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  29.73 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  34.72 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  32.94 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 		 377 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  29.08 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.17 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  27.03 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  27.03 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  33.03 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  32.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  30.08 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  30.58 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  27.15 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  28.06 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  34.57 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  29.61 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3259  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  28.83 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  28.69 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  29.51 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  26.23 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  28.29 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  37.68 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  28.7 
 
 		 208 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  28.99 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1986  hypothetical protein  23.78 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  27.41 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  26.55 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  31.09 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  27.41 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  24.39 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  27.41 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  27.61 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  24.67 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  39.51 
 
 		 210 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  27.41 
 
 		 169 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  27.78 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  27.07 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  25.95 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  25.95 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  24.58 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  39.47 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3854  hypothetical protein  24.81 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0105218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>