17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3029 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1222  hypothetical protein  97.95 
 
 		 147 aa  265  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2253  hypothetical protein  49.66 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000148295  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0050  hypothetical protein  42.67 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.460963  normal  0.607564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3358  hypothetical protein  42.18 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2073  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.890015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0601  hypothetical protein  43.97 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.37511e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0801  hypothetical protein  36.63 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1345  hypothetical protein  33.14 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1864  hypothetical protein  39.13 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2961  hypothetical protein  30.94 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0427134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1975  hypothetical protein  37.23 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.633571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0863  hypothetical protein  30.61 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.801314  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2081  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1996  hypothetical protein  32.86 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1796  hypothetical protein  30.22 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00000863723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4667  hypothetical protein  26 
 
 		 662 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.617278  normal  0.410686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>