18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2961 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2961  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  346  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0427134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0801  hypothetical protein  64.91 
 
 
169 aa  210  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1345  hypothetical protein  57.39 
 
 
178 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0050  hypothetical protein  35.98 
 
 
151 aa  111  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.460963  normal  0.607564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2073  hypothetical protein  36.69 
 
 
150 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.890015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3358  hypothetical protein  36.47 
 
 
145 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2253  hypothetical protein  38.18 
 
 
146 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000148295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0601  hypothetical protein  38.69 
 
 
144 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.37511e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3029  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  84.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0863  hypothetical protein  27.33 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.801314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1222  hypothetical protein  31.33 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1864  hypothetical protein  31.87 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1796  hypothetical protein  30.43 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00000863723  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1975  hypothetical protein  30.82 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.633571  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2081  hypothetical protein  27.04 
 
 
140 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1996  hypothetical protein  26.42 
 
 
140 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4667  hypothetical protein  28.74 
 
 
662 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.617278  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2094  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>