16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2941 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 116 aa  234  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  83.62 
 
 		 116 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2995  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.21 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2429  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  44.64 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2621  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  37.11 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1592  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.08 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  34.02 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2712  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1740  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.12 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000969035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1605  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.78 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3295  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.1 
 
 		 731 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0914  STAS domain protein  36.62 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0237  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 669 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0874018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  35.71 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 106 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>