18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2425 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2425  metallophosphoesterase  100 
 
 
275 aa  557  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.214545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1792  metallophosphoesterase  84.67 
 
 
275 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
343 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  34.5 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
759 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.96 
 
 
473 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
632 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1782  metallophosphoesterase  25 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
286 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  26.96 
 
 
394 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  25.88 
 
 
259 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2833  metallophosphoesterase  20.61 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  24.63 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3804  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0698095  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  26.14 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
460 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  25.14 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>