18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2425 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2425  metallophosphoesterase  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.214545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1792  metallophosphoesterase  84.67 
 
 		 275 aa  428  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1109  metallophosphoesterase  30.42 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0155  metallophosphoesterase  34.5 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  27.06 
 
 		 632 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1782  metallophosphoesterase  25 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3120  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  26.96 
 
 		 394 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0992  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.312522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2833  metallophosphoesterase  20.61 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1664  metallophosphoesterase  27.72 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.334361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3007  metallophosphoesterase  24.63 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000150726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3804  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0698095  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1878  metallophosphoesterase  26.14 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0173468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  24.19 
 
 		 460 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0372  icc protein  25.14 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>