15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2158 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  82.09 
 
 		 296 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  49.48 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  43 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  39.85 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  30.42 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  26.06 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  26.06 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  23.94 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  29.19 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  26.79 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  29.27 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  29.27 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  34.44 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>