22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0510 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  87.39 
 
 		 246 aa  401  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  32.54 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  34.44 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  35.23 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  35.63 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  35.71 
 
 		 311 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  35.63 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  29.21 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  30.6 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  31.21 
 
 		 267 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  27.84 
 
 		 272 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  28.34 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  25.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  27.27 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  30.2 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  26.21 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  28.66 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  24 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  26.62 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  25.34 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>