56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0553 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0553  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  100 
 
 
337 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2909  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  82.14 
 
 
342 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1169  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  51.93 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.171142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1147  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2-like protein  51.93 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0673  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  50.15 
 
 
338 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0578  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2  37.86 
 
 
343 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3761  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  36.9 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4918  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.45 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5614  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  36.34 
 
 
341 aa  182  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000139599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5461  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.54 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5314  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.54 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8662400000000005e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4906  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.54 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5074  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.54 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5396  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.54 
 
 
341 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5339  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II, putative  36.04 
 
 
341 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5016  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.24 
 
 
341 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5345  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.44 
 
 
341 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2681  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  33.46 
 
 
287 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000218103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4082  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  32.1 
 
 
288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  32.1 
 
 
288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3806  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  31.11 
 
 
288 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.155775  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4099  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  30.74 
 
 
288 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000497736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3994  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4028  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.955139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3737  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3721  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4192  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3889  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  30.74 
 
 
288 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1111  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  26.32 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6579  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  23.65 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7913  terminal oxidase subunit II  21.95 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2017  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  24.04 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1001  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.39 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0998  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  23.24 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0940  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.81 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.528842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2202  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  25.23 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000104234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0257  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  32.99 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2244  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  23.99 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.171072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0982  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  23.32 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00231711  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3724  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2- like protein  25.94 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77992  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1766  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.39 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2687  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  20.89 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2591  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  23.91 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1394  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.22 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0429181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0303  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.94 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2000  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  20.59 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  21.55 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3998  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.29 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000400193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2613  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  27.72 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1464  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  20.32 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.663367  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  24.12 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1675  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  23.68 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.186324  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5646  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  21.33 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00094  ubiquinol oxidase subunit II, cyanide insensitive  22.11 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.46 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2039  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.08 
 
 
341 aa  42.7  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>