54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0908 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0908  moaD family protein  100 
 
 		 93 aa  185  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0384  MoaD family protein  36.96 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0246  MoaD family protein  39.13 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  37.63 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  36.96 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  42.55 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  43.62 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  32.61 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  40 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0475  MoaD family protein  35.87 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  33.7 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1541  MoaD family protein  31.58 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0107742  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2128  MoaD family protein  26.32 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  37.89 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.85 
 
 		 443 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  33.7 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0174  MoaD family protein  35.11 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.704451  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  35.87 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  36.67 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  34.78 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  36.17 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  34.78 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  32.61 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  34.41 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24650  MoaD family protein  36.96 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1315  thiamineS protein  31.96 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.538156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  42 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  46 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  37.23 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  37.23 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  37.23 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4790  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.9 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000520563  hitchhiker  0.000000143296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0283  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.98 
 
 		 83 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0391  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.98 
 
 		 83 aa  43.9  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  35.11 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0287  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.98 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0279  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.98 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0286  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.98 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1240  thiamineS protein  34.44 
 
 		 94 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4117  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.04 
 
 		 83 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  32.26 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  32.5 
 
 		 91 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  34.78 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0329  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 		 224 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00555526  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  32.61 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  31.18 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  29.03 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0580  MoaD family protein  34.04 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  32.61 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1335  MoaD family protein  34.02 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383136  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 364 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  28.42 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  32.95 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  42.86 
 
 		 95 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.183154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>