12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3682 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3682  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1724  hypothetical protein  42.11 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1153  hypothetical protein  40.24 
 
 		 198 aa  122  9e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0687  hypothetical protein  37.31 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58970  hypothetical protein  38.82 
 
 		 235 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160858  normal  0.0216719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4442  hypothetical protein  41.88 
 
 		 210 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4702  hypothetical protein  36.03 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15820  hypothetical protein  23.94 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0630612  hitchhiker  0.0000678597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3967  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0782123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3946  hypothetical protein  41.54 
 
 		 155 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3383  hypothetical protein  30.12 
 
 		 203 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0880  HNH endonuclease  31.34 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>