22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1286 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  187  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  80 
 
 		 90 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  74.44 
 
 		 90 aa  153  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  72.22 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  63.33 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  60 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  62.22 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  61.11 
 
 		 92 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  58.89 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  52.81 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  47.78 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  32.58 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  25.84 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  39.06 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7096  hypothetical protein  23.86 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>