33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7220 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7220  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128319  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1761  hypothetical protein  67.16 
 
 
74 aa  88.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000459552  normal  0.237306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3038  hypothetical protein  67.69 
 
 
77 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6793  hypothetical protein  67.19 
 
 
70 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7210  hypothetical protein  66.67 
 
 
82 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3156  hypothetical protein  58.21 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0726  hypothetical protein  63.49 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3019  hypothetical protein  63.08 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  hitchhiker  0.0088907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4034  hypothetical protein  63.49 
 
 
69 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2949  normal  0.231801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1048  hypothetical protein  53.73 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1623  hypothetical protein  55.38 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21130  hypothetical protein  56.72 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8454  hypothetical protein  61.19 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071373  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0766  hypothetical protein  56.92 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25220  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104081  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0700  hypothetical protein  61.82 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0694  hypothetical protein  61.82 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548388  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0714  hypothetical protein  61.82 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0416278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3539  hypothetical protein  55.07 
 
 
78 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0166  hypothetical protein  57.35 
 
 
81 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4685  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.0563131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1784  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00678784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3380  hypothetical protein  52 
 
 
76 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0872841  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1599  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.124638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2786  hypothetical protein  58.82 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.174282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3453  hypothetical protein  44.93 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3763  hypothetical protein  42.19 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5440  hypothetical protein  49.12 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.3804  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06200  hypothetical protein  43.1 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20520  hypothetical protein  48.08 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20330  hypothetical protein  51.22 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.322211  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3318  hypothetical protein  52.38 
 
 
216 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.329513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4305  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.155618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>