29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6481 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  89.62 
 
 		 366 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  39.31 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  47.43 
 
 		 194 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  49.15 
 
 		 194 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  51.72 
 
 		 194 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  48.59 
 
 		 198 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  48.85 
 
 		 191 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  45.86 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  48.55 
 
 		 231 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  44.32 
 
 		 198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  43.39 
 
 		 185 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  28.67 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0572  transport-associated  42.86 
 
 		 84 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  28.47 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3583  hypothetical protein  36.36 
 
 		 92 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1799  hypothetical protein  36.25 
 
 		 84 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2741  transport-associated protein  34.15 
 
 		 82 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.44364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  31.76 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3963  hypothetical protein  35.06 
 
 		 92 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166833  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  26.49 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  25.44 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  24.68 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  27.97 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  34.57 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>