9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5727 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5727  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1217    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6957  hypothetical protein  32.65 
 
 		 652 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6917  hypothetical protein  36.68 
 
 		 441 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1515  hypothetical protein  31.62 
 
 		 795 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1604  hypothetical protein  36.44 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 815 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5109  hypothetical protein  30.2 
 
 		 583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 		 794 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>