20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5644 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5644  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0450  hypothetical protein  55.72 
 
 		 203 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5064  hypothetical protein  38.34 
 
 		 213 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3922  hypothetical protein  37.76 
 
 		 231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0412438  normal  0.137017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1736  hypothetical protein  37.23 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10070  hypothetical protein  37.95 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3929  hypothetical protein  34.22 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3637  hypothetical protein  35.11 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0478158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1509  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0150979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4170  hypothetical protein  34.72 
 
 		 222 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6154  hypothetical protein  50.54 
 
 		 106 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574022  hitchhiker  0.000554125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2923  metal dependent phosphohydrolase  50.53 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1551  hypothetical protein  46.46 
 
 		 104 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4744  hypothetical protein  31.09 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3641  hypothetical protein  31.25 
 
 		 214 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4270  hypothetical protein  33.7 
 
 		 216 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  33.71 
 
 		 375 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2712  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0474019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6286  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000275073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>