20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4693 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4693  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  277  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12619  integral membrane protein  54.96 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.951061  normal  0.527246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1863  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1883  hypothetical protein  48.98 
 
 		 170 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0848062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1929  hypothetical protein  48.98 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0865  hypothetical protein  42.74 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2235  hypothetical protein  45.22 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1155  protein of unknown function DUF350  43.2 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.735897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01250  protein of unknown function (DUF350)  39.86 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.993492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7052  hypothetical protein  38.13 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2756  protein of unknown function DUF350  39.37 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0702  protein of unknown function DUF350  35.77 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.406118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2364  hypothetical protein  38.13 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5175  protein of unknown function DUF350  39.5 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1574  protein of unknown function DUF350  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00727818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2138  protein of unknown function DUF350  40.48 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0116  protein of unknown function DUF350  35.78 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0681  protein of unknown function DUF350  28.37 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5403  hypothetical protein  40.22 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739219  normal  0.527178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>