19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3998 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  46.03 
 
 
127 aa  87  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  41.46 
 
 
268 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  39.37 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  40.57 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  32.58 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  45.79 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  46.46 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  34.15 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  30.71 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  37.21 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  35.16 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  39.39 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  34.38 
 
 
259 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  38.1 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  34.82 
 
 
121 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  40.66 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
286 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  29.31 
 
 
145 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>