30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3765 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  40.71 
 
 
168 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  40.26 
 
 
161 aa  97.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  37.59 
 
 
211 aa  97.1  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  35.21 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  40.6 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  37.14 
 
 
144 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  40.16 
 
 
146 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  37.68 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  34.07 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  36.99 
 
 
418 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  35.51 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  36.17 
 
 
146 aa  83.6  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  41.49 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  31.85 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  34.43 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0149  hypothetical protein  32.12 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  31.78 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  30.71 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  31.45 
 
 
259 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1903  hypothetical protein  33.08 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0401096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  35.34 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  29.57 
 
 
141 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  30.28 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>