35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1999 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 856 aa  1640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  43.84 
 
 		 840 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  30.81 
 
 		 798 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  35.49 
 
 		 857 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  30.54 
 
 		 790 aa  173  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  31.04 
 
 		 752 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  30.18 
 
 		 837 aa  157  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  28.75 
 
 		 789 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  31.33 
 
 		 876 aa  145  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  29.45 
 
 		 751 aa  144  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  33.82 
 
 		 820 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  32.56 
 
 		 759 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  33.64 
 
 		 789 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  37.05 
 
 		 751 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  35.53 
 
 		 748 aa  129  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  37.17 
 
 		 764 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  37.17 
 
 		 764 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  37.17 
 
 		 739 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  31.88 
 
 		 822 aa  123  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  27.64 
 
 		 834 aa  122  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  31.15 
 
 		 820 aa  120  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  29.52 
 
 		 758 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  32.2 
 
 		 747 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  28.09 
 
 		 826 aa  110  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  32.89 
 
 		 756 aa  109  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  33 
 
 		 745 aa  107  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  39.88 
 
 		 777 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  31.65 
 
 		 762 aa  103  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  41.92 
 
 		 758 aa  101  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  44.59 
 
 		 953 aa  101  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  28.53 
 
 		 779 aa  100  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  29.76 
 
 		 719 aa  94  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  35.5 
 
 		 817 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  36.84 
 
 		 761 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 726 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>