15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1374 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  100 
 
 		 756 aa  1510    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  34.55 
 
 		 950 aa  200  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  26.85 
 
 		 698 aa  124  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  26.65 
 
 		 699 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  25.98 
 
 		 711 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  25.92 
 
 		 699 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  28.68 
 
 		 698 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  31.02 
 
 		 719 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  28.75 
 
 		 712 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  25.27 
 
 		 670 aa  50.8  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  29.11 
 
 		 882 aa  49.7  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  25.88 
 
 		 615 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  27.27 
 
 		 744 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  25 
 
 		 666 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  25.31 
 
 		 331 aa  44.3  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>