20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0646 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  69.23 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  59.26 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  64.71 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  64 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  60 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  50 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  58.82 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  62 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  60 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  59.57 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  59.57 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  57.45 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  59.57 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  56 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  54 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  60 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  58.97 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  58 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  58.54 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>