24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3943 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3943  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6430  putative acyl carrier protein (ACP)  77.92 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0172498  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0883  putative acyl carrier protein  57.58 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1634  putative acyl carrier protein  40.91 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0265419  normal  0.0223773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2339  putative acyl carrier protein  38.24 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0414  putative acyl carrier protein  37.68 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230506  normal  0.0244859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0184  putative acyl carrier protein  34.85 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1534  putative acyl carrier protein  34.85 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2747  phosphopantetheine-binding  33.77 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2227  phosphopantetheine-binding  35.71 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  40.91 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  43.1 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1316  hypothetical protein  32.08 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.992369  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1302  acyl carrier protein, putative  32.69 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2031  citrate (Si)-synthase  21.88 
 
 		 473 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  41.38 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1394  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0852964  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  34.25 
 
 		 79 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>