35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3922 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3922  septum formation initiator  100 
 
 
124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13996  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0808  septum formation initiator  69.42 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0202  Septum formation initiator  41.67 
 
 
213 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0429  hypothetical protein  41.38 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.66413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0070  Septum formation initiator  42.98 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  normal  0.200869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32240  septum formation initiator  40.35 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0672  Septum formation initiator  36.21 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.98456  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1037  Septum formation initiator  33.62 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11042  hypothetical protein  33.91 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3131  septum formation initiator  34.45 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.0192356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0891  septum formation initiator  30.08 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4430  Septum formation initiator  31.15 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114489  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1955  septum formation initiator  33.94 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0429748  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5820  Septum formation initiator  31.03 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4239  septum formation initiator  30.56 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4618  septum formation initiator  30.56 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4325  septum formation initiator  30.56 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0834  septum formation initiator  33.6 
 
 
208 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1019  Septum formation initiator  32.28 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4770  septum formation initiator  38.03 
 
 
251 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1908  septum formation initiator  36 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3164  Septum formation initiator  32.29 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1221  Septum formation initiator  31.45 
 
 
238 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000503385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07050  Septum formation initiator  31.53 
 
 
193 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.805805  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8580  hypothetical protein  31.33 
 
 
166 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270504  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1148  septum formation initiator  28.57 
 
 
229 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0910  Septum formation initiator  32.67 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0774  septum formation initiator  33.8 
 
 
203 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.764338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07860  septum formation initiator  29.69 
 
 
252 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.321744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0929  septum formation initiator  39.76 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13460  septum formation initiator  27.93 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0402885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1074  Septum formation initiator  30.61 
 
 
212 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2681  Septum formation initiator  29.2 
 
 
202 aa  42.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1752  cell division protein FtsB  28.4 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.483632  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04990  septum formation initiator  34.85 
 
 
268 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>