24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3200 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3200  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00811968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1708  hypothetical protein  78.48 
 
 		 591 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864094  normal  0.0229836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4277  hypothetical protein  38.65 
 
 		 174 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.333578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2001  hypothetical protein  37.13 
 
 		 172 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2264  hypothetical protein  37.11 
 
 		 172 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15570  hypothetical protein  37.11 
 
 		 163 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.581223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2338  hypothetical protein  35.97 
 
 		 184 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5243  hypothetical protein  38.71 
 
 		 163 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1323  hypothetical protein  32.3 
 
 		 174 aa  89.4  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.248263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2365  putative export or membrane protein  34.87 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2412  putative export or membrane protein  34.87 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2406  putative export or membrane protein  34.21 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3745  putative export or membrane protein  32.88 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291225  normal  0.0249231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2662  putative export or membrane protein  34.25 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11411  hypothetical protein  35.62 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0169137  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2036  hypothetical protein  34.69 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2403  hypothetical protein  37.31 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17980  hypothetical protein  31.9 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1844  hypothetical protein  34.59 
 
 		 183 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.933293  normal  0.367059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1710  hypothetical protein  36.29 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0354776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2583  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12600  hypothetical protein  31.97 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0565366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3003  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.767644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14750  hypothetical protein  32.35 
 
 		 164 aa  42.7  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.361385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>