24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2754 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2754  pyoverdine biosynthesis  100 
 
 		 322 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0236  hypothetical protein  40.51 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1924  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0939  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1225  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2201  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.929811  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0236  hypothetical protein  40.19 
 
 		 349 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1679  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0318  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0228  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  44.89 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0229  pyoverdine chromophore biosynthetic protein PvcA  45.42 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.387563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2987  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  46.01 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35430  pyoverdine biosynthesis protein PvcA  46.01 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000151483  normal  0.0208888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1103  Pyoverdine biosynthesis protein  41.45 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3225  Pyoverdine biosynthesis protein  41.31 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0703  pyoverdine biosynthesis protein  42.7 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.215316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3133  Pyoverdine biosynthesis protein  35.87 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3777  Pyoverdine biosynthesis protein  39.93 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02606  pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02660)  29.72 
 
 		 661 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.195968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  28.67 
 
 		 587 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02705  conserved hypothetical protein, putative pyoverdine/dityrosine biosynthesis protein ditA (Eurofung)  31.5 
 
 		 664 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.365279 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29841  predicted protein  30.06 
 
 		 494 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0522184 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1537  pvcA protein  26.97 
 
 		 608 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1324  hypothetical protein  40.51 
 
 		 853 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.995805  normal  0.179796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>