Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
Locus tag | Francci3_2461 |
Symbol | |
ID | 3905073 |
Type | CDS |
Is gene spliced | No |
Is pseudo gene | No |
Organism name | Frankia sp. CcI3 |
Kingdom | Bacteria |
Replicon accession | NC_007777 |
Strand | - |
Start bp | 2888149 |
End bp | 2901969 |
Gene Length | 13821 bp |
Protein Length | 4606 aa |
Translation table | 11 |
GC content | 69% |
IMG OID | 637879791 |
Product | amino acid adenylation |
Protein accession | YP_481557 |
Protein GI | 86741157 |
COG category | [Q] Secondary metabolites biosynthesis, transport and catabolism |
COG ID | [COG1020] Non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins |
TIGRFAM ID | [TIGR01720] non-ribosomal peptide synthase domain TIGR01720 [TIGR01733] amino acid adenylation domain |
|
|
Plasmid Coverage information |
Num covering plasmid clones | 0 |
Plasmid unclonability p-value | 1 |
Plasmid hitchhiking | No |
Plasmid clonability | normal |
| |
Fosmid Coverage information |
Num covering fosmid clones | 8 |
Fosmid unclonability p-value | 0.782467 |
Fosmid Hitchhiker | No |
Fosmid clonability | normal |
| |
Sequence |
Gene sequence | GTGGCTCAGT TGGAGATAGA GGATCTGTGG CCGCTGTCGC CGTTGCAGGA AGGGCTTCTC TTCCACGCCC TGTATGACGA GCAGGGCTCC GACGTCTACG CGTTGCAGGC CGTACTGGAC ATCGAGGGTC CGCTCGACGC CGCGATCCTG CGGCAGTCCG GCCAGCGGCT GCTGGACCGG CATGCCAACC TGCGGGCCGG GTTCCGGCAG CCCGCGGCGC TGGACCAGCC GGTACAGGTG ATTGCCAGGC AGGTGGAGCT GCCCTGGTCG GAGACGGACT TGTCGGGGCT GCCGGAAGCC ACGGCACAGG CGCGGGCCGG CGAGGCGACG GCCGAGGAGC ACGGCCGCCG GTTTGACCCG GCGGCGCCGC CGTTGCTGCG CTTCCTGCTG ATCCGGTTCG GCGCGCGGCG GCATCGATTG GTGATCACCG TCCACCACAT CCTGCTGGAT GGCTGGTCGC TGTCGGTGCT GCTGCGTGAG CTGTTCGCCG TGTACCGGAG CGGTGGGCGA CTGAACGGGC TGCCGCCGGT GAGGCCCTAC CGGGATCACC TGGCCTGGCT GGGGCAGCAG GATCGGGAAC AGGCCCGTAC GGCGTGGCAG GAGGAGCTGG CCGGGGTCGA CGGGCCGACA CTCGTCGCTG CGGTCGATCC GGCGCAGGCC TCGCCGGAAC CCGGTCGGGT GCGCTTCTCG GTGAGTGAGG AGCTGACGGC GGCGCTGCGC GGCCTGGCCC GCGGTCATGG GCTGACGTTG AACACCCTGA TCCAGGGCGT ATGGGCGATG CTGGTCAGCC GGTTGGCCGG GCGCTCGGAT GTGGTGTTGG GGGCGATGGT GGCCGGCCGT CCGCCCGAGC TGCCCGGTGT GGAGGACATG CTGGGGCTGT TCGTCAACAC 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|
Protein sequence | MAQLEIEDLW PLSPLQEGLL FHALYDEQGS DVYALQAVLD IEGPLDAAIL RQSGQRLLDR HANLRAGFRQ PAALDQPVQV IARQVELPWS ETDLSGLPEA TAQARAGEAT AEEHGRRFDP AAPPLLRFLL IRFGARRHRL VITVHHILLD GWSLSVLLRE LFAVYRSGGR LNGLPPVRPY RDHLAWLGQQ DREQARTAWQ EELAGVDGPT LVAAVDPAQA SPEPGRVRFS VSEELTAALR GLARGHGLTL NTLIQGVWAM LVSRLAGRSD VVLGAMVAGR PPELPGVEDM LGLFVNTVPV RVSLDPNQPV TSMLAALQDR QSALIAHQYL GLAEIQRLAG AGATFDTLFA YESYPSDSPG RAPGEDGLKI SQAVGGLEAT HYPLSLTVLP DERLGFRMTH RPDVFSREAA EGFARSLVEL LEAVAADPGV LVGRVPVLGA AEWVRVVEEW NDTGVGVGVG TLPGVFGGWV AAGRDVVAVV SGGVRVTYGE LEVAANRVAR DLVAAGVRSG DRVGVVMERS VELVAVLVGV VKVGAAYVPV DVEWPVVRVG RVLAEAGVRV VVADVGVSDL PGSVGVVWAG GWVDGEGECG PPAVRVGADD VAYVMYTSGS TGVPKGVAVT HAGVVGLAAD RCWSREVHGR VLFHASHAFD ASTWELWVAL LSGGQVVVAP AGRVDAGVLK GLISDFGPTV VHVTAGLFAA VAEEAPGCFV GVREVVTGGD VVSAAAVVRV VEACPGVVVR QLYGPTEVTV CATVFEVRPG DEVASVVPIG RPMDNTRVFV LDRFLQPVPP GVTGELYVAG VGLARGYFGR PGLTGERFVA CPFSGSGERM YRTGDLGRWT GEGQLVFAGR VDGQVKVRGF RIELGEVEAV LGLYPGVGRC VVVVREDEPG 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