17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1927 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1927  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 86 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4171  phosphopantetheine-binding  58.54 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3968  phosphopantetheine-binding  57.69 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0123563  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0431  putative acyl carrier protein  27.16 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1756  acyl carrier protein  27.16 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0458  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.89611  normal  0.887307 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3419  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  27.63 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 77 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  43.9 
 
 		 1520 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40310  putative acyl carrier protein  34.67 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0674269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  28.74 
 
 		 2664 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3110  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.015067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>