20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1538 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  67.69 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  61.36 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  63.85 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  63.85 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  60 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  56.74 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  56.74 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  59.54 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  53.06 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  56.03 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  62.5 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  56.93 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  61.34 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  52.74 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  55.81 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  52.31 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  52.34 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  54.14 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>